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Nature Methods | 距离血管越近,神经元反应越“反常”?单细胞成像发现空间位置影响fMRI信号

来源:生物探索 发表时间:2026-07-22 阅读:0
7月15日,Nature Methods的研究报道“Simultaneous single-cell calcium imaging of neuronal population activity and brain-wide BOLD fMRI”,研究团队把单细胞钙成像(calcium imaging)与全脑BOLD fMRI放进同一次实验,在清醒小鼠中同时观察局部神经元、血管和全脑信号。结果提示:BOLD信号并不是神经活动的简单平均值,神经元与血管之间的空间位置,也可能改变两者的对应关系。

fMRI看见的不是神经元,而是神经活动留下的“血流后果”

神经元活动增加时,局部代谢需求通常上升,血流、血容量和血氧状态随之改变。fMRI正是通过这些血流动力学变化,间接推断脑活动。这个过程被称为神经血管耦联(neurovascular coupling)。

间接测量带来一个长期存在的解释难题:BOLD升高,究竟对应多少神经元在兴奋?是否也可能同时存在活动下降的细胞?不同细胞类型、血管结构和局部回路,会不会让相同强度的神经活动产生不同的BOLD信号?

传统钙成像能以细胞分辨率追踪神经元活动,却通常只能覆盖有限的皮层区域;fMRI能覆盖全脑,却难以识别信号来自哪些细胞。过去也有研究把光纤记录与fMRI结合,但光纤收集的是一团混合信号,难以区分单个神经元、神经网状结构(neuropil)和非神经细胞。

要回答上述问题,关键不是把两类数据分别采集后再比较,而是在同一只动物、同一次刺激、同一段时间里同步记录。

把显微镜塞进7特斯拉磁场,先要解决“仪器互相干扰”

强磁场、射频脉冲和快速切换的梯度,对普通显微镜并不友好。金属、电子元件和常见光学材料可能引起磁场畸变;MRI脉冲甚至会让相机产生微米级位移。

研究团队因此设计了一套MRI兼容单光子显微镜(MRI-compatible single-photon microscope),将不兼容的光源和电子部件移到磁场影响较小的位置,并通过光纤传递激发光。

镜头材料也经过重新选择。常见BK7玻璃和梯度折射率镜头会造成明显磁敏感伪影,研究人员改用丙烯酸非球面镜片制作小型物镜,并用重水(D₂O)作为浸润介质,减少空气与组织界面造成的信号空洞。测试显示,相机距离磁场中心超过6厘米后,射频诱发的位移基本消失;最终光路将这一距离延长到7.1厘米。

这套系统在小鼠桶状皮层(barrel cortex)获得了1.45平方毫米视野像素分辨率1.1微米,实测光学分辨率为2.5±0.24微米,同时没有观察到明显的BOLD伪影或信噪比下降。换句话说,它把“局部单细胞视角”和“全脑血流动力学视角”稳定地放到了同一时间轴上。

一次胡须刺激,四类信号依次到达峰值

实验使用表达钙指示蛋白GCaMP6f的小鼠,记录桶状皮层第2/3层神经元。为减少麻醉对神经血管耦联的干扰,小鼠在清醒状态下接受成像,并在实验前经历至少10天的适应训练。

每只小鼠接受12轮刺激,每轮用3赫兹气流刺激对侧胡须10秒。全脑fMRI显示,丘脑、纹状体、初级和次级躯体感觉区等多处出现显著BOLD反应。

值得注意的是,听觉皮层也出现强烈激活。论文认为,这可能来自气流装置产生的可听声音,而不只是胡须感觉本身。这个细节很有启发性:全脑成像捕捉到的信号,不仅反映研究人员想研究的过程,也会记录实验装置、运动和应激带来的额外输入。对任何fMRI研究而言,控制条件并不是技术附属品,而是解释结论的一部分。

更值得关注的是四类信号的时间顺序。

神经网状结构的钙信号变化约为2.7%,达到80%峰值只需0.2秒;单细胞群体平均钙信号变化约为1.7%,对应时间为1.1秒;血管直径增加约3.8%,时间为1.4秒;BOLD信号最终变化约4.9%,时间为1.7秒

这个顺序符合神经血管耦联的基本逻辑:神经活动先发生,血管随后扩张,BOLD再以更慢的速度出现。

但这些数字也提醒我们,BOLD不是神经活动的即时复制。它经过了血管反应和血氧变化的“加工”,时间上更慢,空间上也更容易混合多个来源。

神经网状结构和单细胞群体的峰值时间也并不相同。前者包含大量轴突、树突和突触活动,后者是被识别细胞的平均结果。两条曲线之间的差异说明,即使在光学成像内部,“总体活动”也取决于测量对象和汇总方式。

同一个BOLD升高,附近神经元却可能在“反向响应”

研究人员最终从5只小鼠中提取了236个第2/3层神经元,平均每只约46个。随后,他们用支持向量机(support vector machine, SVM)根据单个神经元的钙活动预测局部BOLD变化。

模型的归一化均方根误差显著低于时间打乱后的基线,说明局部神经元群体确实包含可用于解释BOLD的信息。

但最有意思的结果出现在“空间位置”上。

研究团队标注显微视野中的血管,计算每个神经元到最近血管的欧氏距离,再用递归特征消除(recursive feature elimination, RFE)评估哪些神经元对BOLD预测最重要。

对胡须刺激反应增强、在模型中获得正权重的神经元,与血管的距离分布并没有明显特殊性,和总体分布相比P值为0.8919

相反,那些在刺激期间活动下降、对BOLD预测呈负权重的神经元,更靠近血管,P值为0.0440

这意味着,在一个整体BOLD升高的区域内,并非所有细胞都同步兴奋。某些靠近血管的神经元活动下降,局部血管和BOLD信号却仍在上升。

BOLD更像是神经活动、细胞类型、局部回路和血管结构共同加权后的输出,而不是一张简单的“神经元活跃度地图”。

血管旁的神经元为何会与BOLD“唱反调”?

论文提出了一种可能解释:这些神经元或许处在与血管活性中间神经元相关的局部回路中。某些抑制性神经元可通过释放血管活性物质调节血流,例如血管活性肠肽阳性(VIP⁺)细胞倾向于促进血管扩张,而生长抑素阳性(SOM⁺)细胞可能参与血管收缩。

因此,神经元活动下降与血管扩张同时出现,并不一定矛盾。局部回路中可能存在“神经活动方向”和“血管反应方向”不完全一致的组合。

不过,这仍是机制假设,而不是该研究已经直接证明的结论。当前成像主要针对第2/3层锥体神经元,并未在同一实验中同时分辨多种抑制性细胞亚型。

后续需要多色钙成像(multicolor calcium imaging)、细胞类型特异性标记或光遗传学(optogenetics)干预,才能确认哪些细胞在驱动这种反向关系。

局部神经活动,为什么能从远处脑区的BOLD中被读出?

研究团队又把问题反过来:既然一个局部回路受到全脑网络输入,那么远处脑区的BOLD信号,能否预测桶状皮层的神经元群体活动?

结果显示,不仅局部桶状皮层,其他参与胡须感觉处理的皮层和皮层下区域,其BOLD信号也能显著优于时间打乱基线地预测局部钙活动。分析覆盖躯体感觉区、运动区、听觉区、丘脑和纹状体等区域;各区域模型与打乱基线相比的差异达到P≤0.01。刺激同侧与对侧脑区的预测能力则没有显著差异,P值为0.18

这并不表示远处脑区“决定”了局部神经活动。预测关系不能自动等同于因果关系。

更合理的理解是:局部桶状皮层并非孤立工作,它嵌入一个分布式感觉—运动网络中。多个脑区的BOLD变化共享了与该局部回路相关的信息。fMRI看到的全脑图谱,可能包含局部细胞活动在网络中的投影。

这项研究改变了什么,又没有改变什么?

它没有证明人类fMRI过去的解释都是错误的,也没有建立从BOLD精确还原单个神经元活动的通用公式。

实验规模仍然有限:共使用12只小鼠,其中3只因神经活动不足、MRI信噪比较低或植入区信号缺失而被排除;BOLD分析主要基于9只小鼠,单细胞分析只有5只。靠近血管的负响应神经元差异P值为0.0440,而且该比较没有进行多重检验校正,因此更适合被视为需要独立重复的线索。

此外,单光子显微镜难以解析深度,神经元—血管距离是在二维视野中估计的;血管标注主要依据可见的大型软脑膜血管;显微镜视野与MRI体素还没有实现精确共配准;实验采用的也是相对简单的胡须刺激。小鼠桶状皮层的结果不能直接外推到人类复杂认知任务或疾病状态。

但这项研究提供了一个重要的观念修正:解释BOLD时,不能只问“这个脑区是否激活”,还应进一步追问:信号由哪些细胞群贡献?这些细胞与血管如何排列?局部回路中是否同时存在兴奋和抑制?远处网络又提供了多少共享信息?

未来,当多色成像、双光子显微镜与fMRI进一步整合,研究人员可能同时区分兴奋性神经元、抑制性神经元和胶质细胞,并在更深层、更复杂行为中建立细胞活动与全脑信号的映射。

到那时,fMRI图上的一个亮点,或许不再只是“哪里更活跃”,而会逐渐变成一个更具体的问题:究竟是哪一类细胞、通过怎样的血管与网络机制,让这里变亮?

 
 

参考文献

 
Ubaghs RLEM, Boehringer R, Marks M, Hesse HK, Yanik MF, Zerbi V, Grewe BF. Simultaneous single-cell calcium imaging of neuronal population activity and brain-wide BOLD fMRI. Nat Methods. 2026 Jul 15. doi: 10.1038/s41592-026-03154-2. Epub ahead of print. PMID: 42458100.