RH 414 是苯乙烯基吡啶鎓染料。RH 414 可用于突触小泡膜运输的光学监测。

Thiazole Orange 是一种不对称的花青素染料，可与寡核苷酸 (ONs) 偶联制备荧光杂交探针。Thiazole Orange 被广泛应用于生物分子检测和胶体中的 DNA/RNA 染色，并可用于网织红细胞分析。Thiazole Orange 与核酸，特别是 RNA 结合时，会产生显著的荧光增强和高量子产率。Thiazole Orange 能够穿透活细胞膜。Thiazole Orange 可以利用紫外光进行检测，也可以用蓝光进行检测。Thiazole Orange 的激发和发射波长分别为 λex = 510 nm (488 nm 和 470 nm 也有强激发) 和 λem = 527 nm。

DMT-BH1 amidite (BHQ-1 DMT amidite) 是一种真正的暗色猝灭剂，具有宽吸收曲线，覆盖可见光谱，最大值在绿色至黄色区域。它用于合成带有 5'-猝灭剂 DusQ 1 的 qPCR 双标记寡核苷酸探针和其他用于多路复用分析的 FRET 应用。

Acridine Orange hydrochloride 是一种可穿透细胞的核酸选择性荧光染料。Acridine Orange hydrochloride 与 ssDNA 或 RNA 结合时产生橙色荧光，与 dsDNA 结合时产生绿色荧光 (Ex: 488 nM; Em: 530 nm 绿色荧光，640 nm 橙色荧光)。

CLR1501 是荧光标记的、CLR1404 的类似物，是具有癌细胞选择性的细胞荧光标记物。

4,5-Diaminofluorescein 是细胞和组织中一氧化氮 (NO) 的荧光检测剂。

True Blue (NCI 240899) 是一种荧光染料，作为神经元逆行追踪剂 (激发波长 395-425 nm，屏障滤光片 450 nm)。True Blue 可以标记神经元，并且对神经元的活性没有影响。

6-Carboxy-X-rhodamine, succinimidyl ester (6-ROX, SE) 是一种用于寡核苷酸标记和自动 DNA 测序的荧光染料。

DFHBI-2T 是一种可透过膜的 RNA 适配体激活的荧光探针 (ex/em=500 nm/523 nm)。DFHBI-2T 可以用于活细胞中的 RNA 成像。