C12FDG (5-Dodecanoylaminofluorescein di-β-D-Galactopyranoside) 是用于 β-半乳糖苷酶检测的亲脂性绿色荧光底物。C12-FDG 比 Fluorescein di(β-D-galactopyranoside) (HY-101895) 对动物细胞 β-半乳糖苷酶的活性测定更敏感 (Ex/Em = 488/523 nm)。

Fluorescein-5-maleimide 是一种荧光染料。Fluorescein-5-maleimide 可以检测真核细胞中的硫醇氧化还原状态。Fluorescein-5-maleimide 可以标记肽并用于检测带负电荷的纳米颗粒。Fluorescein-5-maleimide 可以标记肌动蛋白来探究其与心肌肌球蛋白结合蛋白C (cMyBP-C) 的相互作用，从而帮助开发小分子调节剂用于心力衰竭。Fluorescein-5-maleimide 可以筛选含有半胱氨酸残基的突变蛋白。Fluorescein-5-maleimide 的激发波长为 494 nm，发射波长为 519 nm。

Janelia Fluor 646, SE (JF646, SE) 是一种红色荧光染料可用于细胞成像实验中。Janelia Fluor 产品根据美国专利获得许可，来自 Howard Hughes Medical Institute 的 No.9,933,417，10,018,624，10,161,932 和其他专利。

C-phycocyanin (C-PC) 是一种蛋白质色素，也广泛用作人类的优良营养补充剂。

Cyanine5 DBCO (DBCO-Cy5) hexafluorophosphate 是一种低毒的叠氮化物反应探针 (近红外荧光染料)，可通过无铜“点击反应”对叠氮化物标记的生物分子进行成像 (Ex=635 nm, Em=650-700 nm)。Cyanine5 DBCO hexafluorophosphate 无明显的细胞和动物毒性，并且不影响靶细胞 (叠氮化标记细胞) 以外的其他细胞的生理功能。Cyanine5 DBCO hexafluorophosphate 可用于体内外细胞的标记和追踪。

FITC，英文全称 Fluorescein Isothiocyanate，中文名称异硫氰酸荧光素，是生物学中应用最为广泛的一种绿色荧光素衍生物。FITC 具有高吸收率和优良的荧光量子产率等特点。FITC 的异硫氰酸基团可与蛋白质上的氨基、巯基、咪唑、酪氨酰、羰基等基团相结合，从而实现包括抗体，凝集素在内的蛋白标记。FITC 除了用作蛋白质标记物，还可用作蛋白质荧光示踪剂，通过标记抗体而快速鉴定病原体，或是用于蛋白质和多肽（HPLC）的微量测序。FITC 的最大激发波长为 494 nm。一旦激发，在最大发射波长 520 nm 处呈黄-绿色荧光。此外，FITC 也是一种能诱发接触超敏反应 (CHS) 的半抗原，并诱导特应性皮炎模型。