2-O-Methylcytosine，一种 O-烷基化类似物和 DNA 的加合物，属于受损的核碱基。

8-Bromoadenine (8-Bromo-9H-purin-6-amine) 是 DNA 放射增敏剂，可抑制细胞中 DNA 单链断裂修复。8-Bromoadenine 是腺嘌呤的溴化衍生物，可通过氘取代溴，制备放射性腺嘌呤。

GTSE1-IN-1 是一种具有口服活性的 GTSE1 抑制剂。GTSE1-IN-1 能够抑制 GTSE1 的转录和表达。GTSE1-IN-1 可通过持续的 DNA 损伤诱导细胞周期停滞和细胞衰老，从而抑制癌细胞增殖。GTSE1-IN-1 可用于癌症研究，如结肠癌和肺癌。

Euscaphic acid 是源于 R. alceaefolius Poir 的三萜，DNA polymerase 抑制剂。Euscaphic acid 抑制小牛 DNA 聚合酶 α (pol α) 和大鼠 DNA 聚合酶 β (pol β) 的 IC50值分别为 61 和 108 μM。Euscaphic acid 诱导细胞凋亡 (apoptosis)。

Demethylasterriquinone B1 (DAQ B1; L-783281) 是一种具有口服活性的胰岛素受体 (insulin receptor) 激动剂和 AKT 激活Demethylasterriquinone B1 通过激活 Akt，进而上调 eNOS 表达和活性、增加 NO 生成，同时下调 NADPH 氧化酶亚基 p22phox 表达、减少氧化应激，高血压大鼠的血管内皮功能障碍。Demethylasterriquinone B1 和 AKT 抑制剂联合用药，通过靶向胰岛素信号通路，激活蚊子的 RNA 干扰和 JAK/STAT 两条抗病毒通路，从而减少寨卡病毒感染。

SMN-C2 ，RG-7916 的类似物，是一种选择性的 SMN2 基因剪接调节剂，通过结合 SMN2 pre-mRNA 起作用，从而增加远上游元件结合蛋白 1 (FUBP1) 和 KH 型剪接的 RNA 结合蛋白的亲和力调节蛋白 (KHSRP) 到 SMN2 pre-mRNA 复合物。SMN-C2 可用于脊髓性肌萎缩症 (SMA) 研究。

Ibezapolstat (ACX-362E) 是一种首创的，具有口服活性的 DNA 聚合酶 IIIC ( DNA pol IIIC) 的抑制剂，被开发用于艰难梭菌感染 (CDI) 的研究。Ibezapolstat 具有广谱的抗艰难梭菌活性，在体外对临床分离的 104 种菌株作用的 MIC 范围为1-8 μg/mL。

DMT-2'O-Methyl-rU Phosphoramidite (2'-O-Me-U Phosphoramidite) 是一种 2'-O-Me 的衍生物，可用于寡核苷酸的合成。

Beaucage reagent 有效应用于DNA切割。